El funcionamiento del analizador de resonancia magnética equivale aproximadamente al uso de un microondas. El analizador de RM usa ondas de radio, que es una forma de radiación no ionizante que es muy fácil de proteger con láminas de metal delgadas (a diferencia de la tecnología que usa radiación ionizante). El analizador de resonancia magnética tiene un blindaje de metal ligero que proporciona niveles de radio muy por debajo de los límites de seguridad pública inmediatamente al lado del analizador.